vcflib

简介

The Variant Call Format (VCF) 是一种平面文件、制表符分隔的文本格式,用于描述个体之间的引用索引变体。 VCF 提供了一种用于描述个体和样本群体变异的通用交换格式,并且已成为各种基因组变异检测器事实上的标准报告格式。

安装方式

可以使用miniconda3进行安装,以Pi2.0为例:

srun -p cpu -n 8 --pty /bin/bash
module load  miniconda3/22.11.1
conda create -n vcflib python=3.8.16
conda activate vcflib
conda install -c bioconda vcflib

参考资料


最后更新: 2024 年 04 月 08 日