Seurat¶
简介¶
Seurat是由 New York Genome Center, Satija Lab 开发的单细胞数据分析集成软件包。其功能不仅包含基本的数据分析流程，如质控，细胞筛选，细胞类型鉴定，特征基因选择，差异表达分析，数据可视化等。同时也包括一些高级功能，如时序单细胞数据分析，不同组学单细胞数据整合分析等。
安装方式¶
可以使用Conda进行安装，以思源一号为例:
srun -p 64c512g -n 4 --pty /bin/bash
module load miniconda3/4.10.3
conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge
conda create -n seurat
source activate seurat
conda install r-seurat
参考资料¶
最后更新:
2024 年 11 月 19 日