NCBI-RMBLASTN¶

简介¶

BLAST是“局部相似性基本查询工具”（Basic Local Alignment Search Tool）的缩写。是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的一个基于序列相似性的数据库搜索程序。该程序将DNA/蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对，从而找到相似序列。

安装命令¶

以下给出在Pi2.0平台通过spack安装该软件的命令：

spack install ncbi-rmblastn@2.11.0 %gcc@8.5.0

以下给出在Pi2.0平台编译安装该软件的命令：

tar zxvf rmblast-1.0-ncbi-blast-2.2.28+.tar.gz
cd rmblast-1.0-ncbi-blast-2.2.28+-src/c++/
srun -n 4 -p cpu --pty /bin/bash
./configure --with-mt --prefix=path/to/rmblastn --without-debug
make
make install

参考资料¶

RMBlast
Rmblastn Readme
Rmblastn tar

最后更新: 2024 年 11 月 19 日