Lumpy

简介

lumpy是目前比较流行的一款SV检测工具,它同时支持PEM与SR和RD三种模式。在biostar上很多用户推荐, 在lumpy所发的文章中,与Pindel,delly,gasvpro等软件比较,也有不错的效果。软件使用也非常容易, 不仅支持gemrline样品,也支持somatic样品。

完整步骤

module load miniconda3
conda create -n mypy_py27 python=2.7
source activate mypy_py27
conda install -c bioconda lumpy-sv

最后更新: 2024 年 06 月 25 日