Lumpy¶
简介¶
lumpy是目前比较流行的一款SV检测工具，它同时支持PEM与SR和RD三种模式。在biostar上很多用户推荐， 在lumpy所发的文章中，与Pindel，delly，gasvpro等软件比较，也有不错的效果。软件使用也非常容易， 不仅支持gemrline样品，也支持somatic样品。
完整步骤¶
module load miniconda3
conda create -n mypy_py27 python=2.7
source activate mypy_py27
conda install -c bioconda lumpy-sv
最后更新:
2024 年 11 月 22 日