跳转至

上海交大超算平台用户手册 Documentation

GMAP-GSNAP

正在初始化搜索引擎

上海交大超算平台用户手册 Documentation

Getting Started
快速上手
平台硬件资源
账号及充值
可视化平台
登录交我算集群
文件系统与数据访问
提交作业
容器
软件
软件
- 软件模块使用方法
- 编译器、MPI库、数学库、应用工具
- 基准测试
- AI 计算
- 原子分子工程计算
- 生物信息计算
  生物信息计算
  - AlphaFold2
  - AUGUSTUS
  - Aspera
  - BASIL-ANISE
  - BatVI
  - BCFtools
  - BEDTOOLS2
  - BICseq2
  - Bismark
  - Blast-plus
  - BOWTIE
  - BOWTIE2
  - BreakDancer
  - BWA
  - CCMpred
  - cd-hit
  - CDO
  - celldex
  - CellPhoneDB
  - cdsapi
  - CLEVER
  - CNVkit
  - CNVnator
  - Control-FERRC
  - ColabFold
  - CREST
  - CUFFLINKS
  - chimera
  - Cell Ranger
  - DeepGo
  - DeepVariant
  - DELLY
  - DESeq2
  - DoubletFinder
  - ERDS
  - FastQC
  - FermiKit
  - FSL
  - GATK
  - GEANT4
  - GenomeStrip
  - GMAP-GSNAP GMAP-GSNAP
    目录
    
    简介
  - GRAPHMAP
  - GRIDSS
  - GsUtil
  - Harmony
  - HISAT2
  - HMMER
  - Hydra-sv
  - km
  - LUMPY-SV
  - Lumpy
  - MAKER
  - Manta
  - MEGAHIT
  - MELT
  - MetaSV
  - METIS
  - Mfuzz
  - MindTheGap
  - Mobster
  - Monocle 3
  - MrBayes
  - Minimap2
  - NCBI-RMBLASTN
  - OpenSlide-python
  - pandas
  - PBSV
  - PGA
  - PERCOLATOR
  - PICARD
  - Pindel
  - PRISM
  - r-rgl
  - RELION
  - RetroSeq
  - RFdiffusion
  - RNA-SEQC
  - RoseTTAFold
  - SALMON
  - Samtools
  - Seurat
  - Sniffles
  - SOAPDENOVO2
  - sra-tools
  - SRATOOLKIT
  - STAR-Fusion
  - STRINGTIE
  - STRique
  - SV2
  - SvABA
  - SVDetect
  - TOPHAT
  - VARDICTJAVA
  - VariationHunter
  - VSEARCH
  - WGCNA
  - Wham
  - Rosetta
  - Hic_breakfinder
  - STAR
  - EasyFuse
  - MetaWRAP
  - GATE
  - pangenie
  - Clustalo
  - Space Ranger
  - vcflib
常见问题
文档下载

目录

简介

GMAP-GSNAP¶

简介¶

mRNA和EST序列的基因组定位和比对程序。

最后更新: 2024 年 04 月 08 日

上一页 GenomeStrip

下一页 GRAPHMAP

© Copyright 2024, 上海交通大学网络信息中心.

Created using Sphinx 7.1.2. and Sphinx-Immaterial