FSL¶

简介¶

FSL是功能磁共振成像、核磁共振成像和DTI脑成像数据的综合分析工具库。

运行FSL的方式¶

使用sbatch提交运行脚本(fsl.slurm):

#!/bin/bash

#SBATCH --job-name=fsl
#SBATCH --partition=cpu
#SBATCH -N 1
#SBATCH --ntasks-per-node=40
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err

module load fsl/6.0-fsl-gcc-4.8.5
fsl $PWD run.sh

脚本run.sh示例如下（fsl.slurm、run.sh和数据要在同一目录下）:

#!/bin/bash
eddy_correct DWI.nii.gz DWI_eddy.nii.gz 0

使用如下指令提交：

$ sbatch fsl.slurm

可视化运行方式(在Studio里的远程桌面运行)¶

module load fsl/6.0-fsl-gcc-4.8.5
fsl_gui

最后更新: 2024 年 04 月 08 日