FSL¶
简介¶
FSL是功能磁共振成像、核磁共振成像和DTI脑成像数据的综合分析工具库。
运行FSL的方式¶
使用sbatch提交运行脚本(fsl.slurm):
#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=fsl
#SBATCH --partition=cpu
#SBATCH -N 1
#SBATCH --ntasks-per-node=40
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err
module load fsl/6.0-fsl-gcc-4.8.5
fsl $PWD run.sh
脚本run.sh示例如下(fsl.slurm、run.sh和数据要在同一目录下):
#!/bin/bash
eddy_correct DWI.nii.gz DWI_eddy.nii.gz 0
使用如下指令提交:
$ sbatch fsl.slurm
可视化运行方式(在Studio里的远程桌面运行)¶
module load fsl/6.0-fsl-gcc-4.8.5
fsl_gui
最后更新:
2024 年 10 月 11 日