celldex¶

简介¶

celldex包提供一组参考表达数据集，这些数据集带有精确的细胞类型标签，用于单细胞数据的自动注释或批量RNA序列的反卷积等过程。

安装方式¶

可以使用Conda进行安装，以思源一号为例:

srun -p 64c512g -n 4 --pty /bin/bash
module load miniconda3/4.10.3
conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge
conda create -n celldex
source activate celldex
conda install bioconductor-celldex

参考资料¶

LTLA/celldex

最后更新: 2024 年 11 月 22 日