SPOOLES

SPOOLES的全称是SParse Object Oriented Linear Equations Solver,中文名大概就是面向对象的稀疏线性等式解析器。顾名思义,就是可以用来解稀疏矩阵为参数的线性方程组的数学函数库。所谓面向对象是指的应用了面向对象的封装思想,但实际上SPOOLES是用非面向对象的C语言来写的。

最新版是2.2,支持单线程,多线程和MPI三种计算模式。

安装教程

首先,下载并解压软件包

srun -p 64c512g -N 1 -n 2 --pty /bin/bash
cd
mkdir spooles
cd spooles
wget http://www.netlib.org/linalg/spooles/spooles.2.2.tgz
tar xf spooles.2.2.tgz && rm -rf spooles.2.2.tgz

然后,导入MPI环境

module load openmpi/4.1.1-gcc-8.3.1

接下来,修改 Make.inc 文件即可

主要修改 CCMPI_INSTALL_DIR 的位置即可

# CC = /opt/mpi/bin/mpicc
修改为
CC = /dssg/opt/icelake/linux-centos8-icelake/gcc-8.3.1/openmpi-4.1.1-me4z4iiamxv3l6efci5wcmjd2pk4rvye/bin/mpicc

将
MPI_INSTALL_DIR = /usr/local/mpich-1.0.13
修改为
MPI_INSTALL_DIR = /dssg/opt/icelake/linux-centos8-icelake/gcc-8.3.1/openmpi-4.1.1-me4z4iiamxv3l6efci5wcmjd2pk4rvye

将
MPI_LIB_PATH = -L$(MPI_INSTALL_DIR)/lib/solaris/ch_p4
修改为
MPI_LIB_PATH = -L/dssg/opt/icelake/linux-centos8-icelake/gcc-8.3.1/openmpi-4.1.1-me4z4iiamxv3l6efci5wcmjd2pk4rvye/lib

将
#  MPI_LIBS = $(MPI_LIB_PATH) -lmpi -lpthread
修改为
MPI_LIBS = $(MPI_LIB_PATH) -lmpi -lpthread

最后,执行编译命令

make lib
make

成功的标志

生成 spooles.a 等库文件,既代表编译成功

参考资料


最后更新: 2024 年 11 月 14 日