Intel-MPI

英特尔® MPI 库是一个实现开源 MPICH 规范的多结构消息传递库。使用该库创建、维护和测试高级、复杂的应用程序,这些应用程序在基于英特尔® 处理器的高性能计算 (HPC) 集群上表现更好。

加载预安装的Intel组件

可以用以下命令加载集群中已安装的Intel组件:

版本

加载方式

组件说明

intel-mpi-2021.4.0

module load intel-oneapi-mpi/2021.4.0 module load intel-oneapi-compilers/2021.4.0

Intel MPI库

intel-mpi-2019. 4.243

module load intel-mpi/2019.4.243

Intel MPI库

intel-mpi-2019. 6.154

module load intel-mpi/2019.6.154

Intel MPI库

在使用intel-mpi的时候,请尽量保持编译器版本与后缀中的编译器版本一致,如intel-mpi-2019.4.243/intel-19.0.4和intel-19.0.4 另外我们建议直接使用Intel全家桶

使用Intel+Intel-mpi编译应用

这里,我们演示如何使用系统中的Intel和Intel-mpi编译MPI代码,使用的MPI代码可以在/lustre/share/samples/MPI/mpihello.c中找到。

加载和编译:

$ module load intel-parallel-studio/cluster.2019.5-intel-19.0.5
$ mpiicc mpihello.c -o mpihello

提交Intel+Intel-mpi应用

准备一个 mpihello.c 程序

#include "mpi.h"
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int  main(int argc,char* argv[])
{
     int myid,numprocs;
     int namelen;
     char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
     MPI_Init(&argc,&argv);
     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid);
     MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numprocs);
     MPI_Get_processor_name(processor_name,&namelen);
     printf("Hello World! Process %d of %d on %s\n",myid,numprocs,processor_name);
     MPI_Finalize();

     return 0;
 }

准备一个名为job_impi.slurm的作业脚本

#!/bin/bash

#SBATCH --job-name=mpihello
#SBATCH --partition=small
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err
#SBATCH -n 2

ulimit -s unlimited
ulimit -l unlimited

module load intel-parallel-studio/cluster.2019.5-intel-19.0.5

mpiicc mpihello.c -o mpihello

mpirun -np 2 ./mpihello

若采用 intel 2018,脚本中 export I_MPI_FABRICS=shm:ofi 这行需改为 export I_MPI_FABRICS=shm:tmi

最后,将作业提交到SLURM

$ sbatch job_impi.slurm

参考资料


最后更新: 2024 年 04 月 08 日