OpenMPI¶
简介¶
OpenMPI是一个免费的、开源的MPI实现,兼容MPI-1和MPI-2标准。OpenMPI由开源社区开发维护,支持大多数类型的HPC平台,并具有很高的性能。
OpenMPI使用说明¶
思源一号上的OpenMPI¶
先创建一个目录openmpitest并进入该目录:
mkdir openmpitest
cd openmpitest
在该目录下创建如下测试文件openmpitest.c:
#include "stdio.h"
#include "mpi.h"
#include "omp.h"
#include "math.h"
#define NUM_THREADS 8
long int n = 10000000;
int main(int argc, char *argv[])
{
int my_rank, numprocs;
long int i, my_n, my_first_i, my_last_i;
double my_pi = 0.0, pi, h, x;
MPI_Init(&argc, &argv);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_rank);
h = 1.0 / n;
my_n = n / numprocs;
my_first_i = my_rank * my_n;
my_last_i = my_first_i + my_n;
omp_set_num_threads(NUM_THREADS);
#pragma omp parallel for reduction(+ : my_pi) private(x, i)
for (i = my_first_i; i < my_last_i; i++)
{
x = (i + 0.5) * h;
my_pi = my_pi + 4.0 / (1.0 + x * x);
}
MPI_Reduce(&my_pi, &pi, 1, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD);
if (my_rank == 0)
{
printf("Approximation of pi:%15.13f\n", pi * h);
}
MPI_Finalize();
return 0;
}
在该目录下创建如下作业提交脚本openmpitest.slurm:
#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=openmpitest
#SBATCH --partition=64c512g
#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH -n 4
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err
ulimit -s unlimited
ulimit -l unlimited
module load gcc
module load openmpi/4.1.1-gcc-8.3.1
mpicc openmpitest.c -o openmpitest -fopenmp
mpirun -np 4 ./openmpitest
使用如下命令提交作业:
sbatch openmpitest.slurm
作业完成后在.out文件中可看到如下结果:
Approximation of pi:3.1415926535898
pi2.0上的OpenMPI¶
此步骤和上文完全相同;
此步骤和上文完全相同;
在该目录下创建如下作业提交脚本openmpitest.slurm:
#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=openmpitest
#SBATCH --partition=small
#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH -n 4
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err
ulimit -s unlimited
ulimit -l unlimited
module load gcc
module load openmpi/3.1.5-gcc-9.2.0
mpicc openmpitest.c -o openmpitest -fopenmp
mpirun -np 4 ./openmpitest
使用如下命令提交作业:
sbatch openmpitest.slurm
作业完成后在.out文件中可看到如下结果:
Approximation of pi:3.1415926535898
参考资料¶
最后更新:
2024 年 11 月 14 日