OpenMPI

简介

OpenMPI是一个免费的、开源的MPI实现，兼容MPI-1和MPI-2标准。OpenMPI由开源社区开发维护，支持大多数类型的HPC平台，并具有很高的性能。

OpenMPI使用说明

思源一号上的OpenMPI

  1. 先创建一个目录openmpitest并进入该目录：

mkdir openmpitest
cd openmpitest

  1. 在该目录下创建如下测试文件openmpitest.c：

#include "stdio.h"
#include "mpi.h"
#include "omp.h"
#include "math.h"

#define NUM_THREADS 8
long int n = 10000000;

int main(int argc, char *argv[])
{
    int my_rank, numprocs;
    long int i, my_n, my_first_i, my_last_i;
    double my_pi = 0.0, pi, h, x;

    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_rank);
    h = 1.0 / n;
    my_n = n / numprocs;
    my_first_i = my_rank * my_n;
    my_last_i = my_first_i + my_n;

    omp_set_num_threads(NUM_THREADS);
#pragma omp parallel for reduction(+ : my_pi) private(x, i)
    for (i = my_first_i; i < my_last_i; i++)
    {
        x = (i + 0.5) * h;
        my_pi = my_pi + 4.0 / (1.0 + x * x);
    }

    MPI_Reduce(&my_pi, &pi, 1, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD);

    if (my_rank == 0)
    {
        printf("Approximation of pi:%15.13f\n", pi * h);
    }

    MPI_Finalize();

    return 0;
}

  1. 在该目录下创建如下作业提交脚本openmpitest.slurm:

#!/bin/bash

#SBATCH --job-name=openmpitest
#SBATCH --partition=64c512g
#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH -n 4
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err

ulimit -s unlimited
ulimit -l unlimited

module load gcc
module load openmpi/4.1.1-gcc-8.3.1

mpicc openmpitest.c -o openmpitest -fopenmp

mpirun -np 4 ./openmpitest

  1. 使用如下命令提交作业：

sbatch openmpitest.slurm

  1. 作业完成后在.out文件中可看到如下结果：

Approximation of pi:3.1415926535898

pi2.0上的OpenMPI

  1. 此步骤和上文完全相同；

  2. 此步骤和上文完全相同；

  3. 在该目录下创建如下作业提交脚本openmpitest.slurm:

#!/bin/bash

#SBATCH --job-name=openmpitest
#SBATCH --partition=small
#SBATCH --ntasks-per-node=1
#SBATCH -n 4
#SBATCH --output=%j.out
#SBATCH --error=%j.err

ulimit -s unlimited
ulimit -l unlimited

module load gcc
module load openmpi/3.1.5-gcc-9.2.0

mpicc openmpitest.c -o openmpitest -fopenmp

mpirun -np 4 ./openmpitest

  1. 使用如下命令提交作业：

sbatch openmpitest.slurm

  1. 作业完成后在.out文件中可看到如下结果：

Approximation of pi:3.1415926535898

参考资料

最后更新: 2024 年 04 月 08 日