RStudio¶

简介¶

RStudio是一个集成开发环境，主要支持R编程语言，专用于统计计算和图形。它包括一个控制台，支持代码执行的语法编辑器，以及用于绘制，调试和管理工作区的工具。

可用的版本¶

R版本	平台	RStudio版本
4.2.2		2022.12.0
4.1.3		2022.02.1
4.0.2		1.2.5042
3.6.3		1.2.5042

如何使用¶

使用超算的账号及密码登录 HPC Studio ，在导航栏 Interactive Apps 中选择 RStudio Server ，如下图：

点击后会出现相关的启动界面，可以设置作业时间，资源情况，软件版本。设置完成后 Launch 即可运行：

小技巧

π2.0 集群和思源一号的数据不互通，注意区分。

待界面从排队变成 Running 后，可通过 Connect to RStudio Server 连接到 Rstudio Server ：

运行示例¶

所需的 R 依赖包需要自行安装：

# Upload library
library(circlize)
circos.par("track.height" = 0.4)

# Create data
data = data.frame(
  factor = sample(letters[1:8], 1000, replace = TRUE),
  x = rnorm(1000),
  y = runif(1000)
)

# Step1: Initialise the chart giving factor and x-axis.
circos.initialize( factors=data$factor, x=data$x )

# Step 2: Build the regions.
circos.trackPlotRegion(factors = data$factor, y = data$y, panel.fun = function(x, y) {
  circos.axis()
})

# Step 3: Add points
circos.trackPoints(data$factor, data$x, data$y, col="#69b3a2")

最后更新: 2024 年 11 月 19 日