RStudio¶
简介¶
RStudio是一个集成开发环境,主要支持R编程语言,专用于统计计算和图形。它包括一个控制台,支持代码执行的语法编辑器,以及用于绘制,调试和管理工作区的工具。
可用的版本¶
R版本 |
平台 |
RStudio版本 |
---|---|---|
4.2.2 |
2022.12.0 |
|
4.1.3 |
2022.02.1 |
|
4.0.2 |
1.2.5042 |
|
3.6.3 |
1.2.5042 |
如何使用¶
使用超算的账号及密码登录 HPC Studio ,在导航栏 Interactive Apps
中选择 RStudio Server
,如下图:
点击后会出现相关的启动界面,可以设置作业时间,资源情况,软件版本。设置完成后 Launch
即可运行:
小技巧
π2.0 集群和思源一号的数据不互通,注意区分。
待界面从排队变成 Running
后,可通过 Connect to RStudio Server
连接到 Rstudio Server
:
运行示例¶
所需的 R
依赖包需要自行安装:
# Upload library
library(circlize)
circos.par("track.height" = 0.4)
# Create data
data = data.frame(
factor = sample(letters[1:8], 1000, replace = TRUE),
x = rnorm(1000),
y = runif(1000)
)
# Step1: Initialise the chart giving factor and x-axis.
circos.initialize( factors=data$factor, x=data$x )
# Step 2: Build the regions.
circos.trackPlotRegion(factors = data$factor, y = data$y, panel.fun = function(x, y) {
circos.axis()
})
# Step 3: Add points
circos.trackPoints(data$factor, data$x, data$y, col="#69b3a2")
最后更新:
2024 年 10 月 11 日