AlphaFold-GUI¶
登录HPC Studio平台后,在自定义软件中选择AlphaFold,如下图
点击后会出现下图的选项卡,里面定义好了所需的选项卡,可以创建个人项目,(注:项目下可以创建多个作业,作业运行结果保存在该项目路径下)
创建项目选项卡如下图所示,类型选择AlphaFold,按要求填写表项 点击”保存“
点击创建好的项目,选择“创建新的作业”按钮,如下图:
编辑作业,完成后点击"保存",注意脚本文件路径,会自动弹出蛋白序列文件,如下图:
点击"查看作业结果",可以查看所有作业的运行结果,如下如:
参考资料¶
AlphaFold Operation Manual https://docs.hpc.sjtu.edu.cn/app/bioinformatics/alphafold2.html?highlight=alpha
最后更新:
2024 年 11 月 14 日