科学数据平台使用指南

上海交通大学科学数据平台首页地址为:https://scidata.sjtu.edu.cn,秉承FAIR原则,致力打造科学数据全生命周期管理平台

用户登录

科学数据平台使用jAccount进行登录认证,在首页找到“login”按钮后,点击跳转至jAccount认证界面。使用账号密码认证通过后,自动跳转至网站首页。 首次登录前,需要在“交我办”中,找到“交我算”-“数据发布”-“科学数据平台账号激活申请”,申请账号激活。

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发布数据

创建一条记录并添加数据文件

点击右上角“+”号,在下拉选项中选择“upload”即可进入数据发布页面。 数据文件可以通过浏览器拖拽或点选文件上传,如果没有数据文件,仅有元数据信息,则勾选“Metadata-only record”。

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发布超算集群上的文件

1.登录可视化平台,选择desktop服务,填写需要的核心数及时长。

2.在桌面端打开网页服务,登录https://scidata.sjtu.edu.cn,找到发布数据的入口,正常提交数据即可。此时,可以通过按钮将超算账号下的文件直接选中、发布。

添加元数据信息

补充完善此条记录的元数据信息,尤其是必填信息。 资金支持、备选标识符、相关工作等条目,如果没有可以点击“x”删除

设定访问权限

权限设置可对元数据和数据文件单独控制,细分三类:完全公开、公开元数据、完全私有。 注意:权限设置需要谨慎,完全公开的数据,其他人将能够看到、搜索、下载所有提交的数据文件;如果成果仍在投稿阶段,需要将数据设置有私有,可以通过专属链接提供至编辑访问。

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建立团队空间

点击右上角“+”号,在下拉选项中选择“new community”,填写名称、标识符、简介等信息后,点击创建。

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分享数据

在数据详情页面,点击右侧的“Share”按钮,可以生成数据详情页的相关链接。 合作者收到链接后,点击即可查看该数据的详情页面。这种数据分享方式,即使权限设置为非公开,链接接收者仍然能够访问。 请注意保护数据安全

下载数据

包含文件的数据,在描述下方会展示所有相关联的文件,每个单独的文件名后方,具有一个方形的“download”按钮。可以直接点击按钮通过浏览器进行下载,或者右键按钮并复制链接,在命令行中使用下载工具下载。

检索数据

科学数据平台首页附有搜索框,通过输入关键词可以对相关数据进行搜索。在搜索结果页面左侧,支持对查找到数据的状态、类型进行筛选。

开源科学数据下载

为了方便“交我算”用户使用公共开源科学数据,尤其是国外的大型公共数据,平台提供了常用公共数据的镜像。用户可以在"community"中找到所需开源科学数据的类别,进入详情页面查看数据的使用方法。 同样,也可以直接在搜索框中检索需要的数据库名称,查看使用方法。 【P.S.】开源科学数据扩充中,如果您有需要使用的大型开源科学数据,欢迎发邮件到hpc@sjtu.edu.cn咨询。

本文作者:王星泽

最后更新: 2024 年 11 月 22 日