常见问题

Q：计算节点不能访问互联网/不能下载数据

A： 计算节点是通过proxy节点代理进行网络访问的，因此一些软件需要特定的代理设置。需要找到软件的配置文件，修改软件的代理设置。

  1. git、wget、curl等软件支持通用变量，代理参数设置为：

# 思源一号计算节点通用代理设置
https_proxy=http://proxy2.pi.sjtu.edu.cn:3128
http_proxy=http://proxy2.pi.sjtu.edu.cn:3128
no_proxy=puppet,proxy,172.16.0.133,pi.sjtu.edu.cn

 # π2.0计算节点通用代理设置
http_proxy=http://proxy.pi.sjtu.edu.cn:3004/
https_proxy=http://proxy.pi.sjtu.edu.cn:3004/
no_proxy=puppet

  1. Python、MATLAB、Rstudio、fasterq-dump等软件需要查询软件官网确定配置参数：

### fasterq-dump文件，配置文件路径 ~/.ncbi/user-settings.mkfg

# 思源一号节点代理设置
/tools/prefetch/download_to_cache = "true"
/http/proxy/enabled = "true"
/http/proxy/path = "http:/proxy2.pi.sjtu.edu.cn:3128"

# π2.0节点代理设置
/tools/prefetch/download_to_cache = "true"
/http/proxy/enabled = "true"
/http/proxy/path = "http://proxy.pi.sjtu.edu.cn:3004"

### Python需要在代码里面指定代理设置，不同Python包代理参数可能不同

# 思源一号节点代理设置
proxies = {
    'http': 'http://proxy2.pi.sjtu.edu.cn:3128',
    'https': 'http://proxy2.pi.sjtu.edu.cn:3128',
}
# π2.0节点代理设置
proxies = {
    'http': 'http://proxy.pi.sjtu.edu.cn:3004',
    'https': 'http://proxy.pi.sjtu.edu.cn:3004',
}

### MATLAB

# 思源一号节点代理设置
proxy2.pi.sjtu.edu.cn:3128

# π2.0节点代理设置
proxy.hpc.sjtu.edu.cn:3004
最后更新: 2024 年 05 月 03 日