Hydra-sv

简介

用于使用双端映射检测结构变异 (SV) 断点。与其他算法类似,Hydra 通过对不一致的双端对齐进行聚类来检测 SV 断点, 其“签名”证实了相同的假定断点。Hydra 可以检测由所有类别的结构变异引起的断点。它还旨在检测独特和重复基因组区域 的变异(例如,片段重复和转座子插入中的突变);因此,它将检查具有多个不一致比对的配对末端读数。

完整步骤

module load miniconda3
conda create -n mypy_py27 python=2.7
source activate mypy_py27
conda install -c conda-forge hydra